جداسازی و کلونینگ ژن اکسیدوردوکتاز از یک سویه باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس

Authors

جمشید راهب

j. raheb center of genetic engineering and biotechnology, tehran, iranپژوهش گاه ملی تحقیقات مهندسی ژنتیک و تکنولوژی زیستی الهام آقائی مقدم

e. aghaee-moghaddam center of genetic engineering and biotechnology, tehran, iranپژوهش گاه ملی تحقیقات مهندسی ژنتیک و تکنولوژی زیستی شمیم نقدی

s. naghdi center of genetic engineering and biotechnology, tehran, iranپژوهش گاه ملی تحقیقات مهندسی ژنتیک و تکنولوژی زیستی مه لقا قربانلی

m. ghorbanli gorgan azad university, gorgan, iranدانشگاه آزاد اسلامی گرگان غلامرضا بخشی خانیکی

abstract

سابقه و هدف: یکی از محدودیت های فرآیند پالایش و مصرف مواد نفتی مشکلات ناشی از وجود ترکیبات گوگردی در آن ها است. استفاده از سوخت های فسیلی منجر به آزادسازی so2 و به دنبال آن آلودگی محیط زیست می شود. برای حل این مشکلات، حذف میکروبی گوگرد پیشنهاد شده است. از آن جا که کارایی باکتری های سولفورزدا محدود است، توجه محققین به افزایش کارایی آن ها از طریق دست کاری های ژنتیکی معطوف شده است. انجام چنین دست کاری هایی معطوف به بررسی ژنتیک فرایند حذف گوگرد باکتری های بومی و سپس کلون کردن ژن های مؤثر در این فرایند است. در این رابطه، چند سویه باکتری در ایران جداسازی شدند و مورد بررسی قرار گرفتند. سه ژن c، b و a dsz، دارای توالی dnaی، ٤ کیلوبازی هستند که حامل ژن های سولفورزدا برای مسیر 4s می باشند، که این توالی، در باکتری تازه جدا شده رودوکوکوس fmf شناسایی و جداسازی شد و سپس در باکتری سودوموناس آئروجینوزا کلون گردید. ژن dszd تولید کننده آنزیم اکسیدوردکتاز در جهت مسیر سولفورزدایی 4s می باشد. در این طرح اقدام به شناسایی، جداسازی و کلونینگ dszd از یک سویه باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس نموده و سپس کلون مذکور را تأیید نمودیم. مواد و روش ها: یک سویه باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس را که دارای فعالیت سولفورزدایی است در داخل شیکر انکوباتور rpm ٢٠٠ و٣٧ درجه سانتی گراد رشد داده شد و dna ژنومی آن استخراج گردید و سپس در شرایط بهینه، pcr انجام گرفت. ژن اکسیدوردوکتاز (ژن dszd) از روی ژل آگارز استخراج و در پلاسمید ptz57r کلون و داخل میزبان α) e-coli (dh5 ترانسفورم شد. نقشه ژنی این پلاسمید نوترکیب با آنزیم های محدودکننده به دست آمد و سپس تعیین توالی و همولوژی های لازم انجام گرفت. یافته ها: با توجه به این که باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس igts8 استاندارد، دارای سویه های مختلف می باشد و همین طور از تشابه توالی نوکلئوتیدی بین ژن اکسیدوردوکتاز باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس igts8 استاندارد و ژن اکسیدوردوکتاز رودوکوکوس اریتروپولیس مورد آزمایش، این طور به نظر می رسد که سویه در دست بررسی می تواند شباهت ها و یا قرابت هایی با باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس igts8 استاندارد داشته باشد. نتیجه گیری: نتیجه سکانس ژن اکسیدوردوکتاز این سویه از باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس که تحت نام frf.seq است، نشان می دهد که تعداد نوکلئوتیدهای مربوط به ژن اکسیدوردوکتاز باکتری مورد آزمایش مساوی با تعداد نوکلئوتیدهای مربوط به باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس igts8 استاندارد یعنی bp۵٧٩ است.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

افزایش قدرت سولفورزدایی بیولوژیک از طریق کلونینگ و بیان ژن اکسیدوردوکتاز بدست آمده از باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس IGTS8 با استفاده از وکتور بیانی PET21a

سابقه و هدف: بیودسولفوریزاسیون یک روش میکروبی است که طی آن با استفاده از سویه‌های بهینه شده باکتریایی سعی در افزایش توان قدرت گوگردزدایی از ترکیبات نفتی می‌شود، یکی از روش‌های موثر استفاده از ژن‌های اکسیدوردوکتاز افزایش یافته می‌باشد که FMNH2 مورد نیاز برای فعالیت ژن‌های گوگردزدایی را در دسترس قرار می‌دهند. در این مطالعه ژن اکسیدوردوکتاز باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس IGTS8 که به عنوان یک سویه ...

full text

افزایش قدرت سولفورزدایی بیولوژیک از طریق کلونینگ و بیان ژن اکسیدوردوکتاز بدست آمده از باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس igts۸ با استفاده از وکتور بیانی pet۲۱a

سابقه و هدف: بیودسولفوریزاسیون یک روش میکروبی است که طی آن با استفاده از سویه های بهینه شده باکتریایی سعی در افزایش توان قدرت گوگردزدایی از ترکیبات نفتی می شود، یکی از روش های موثر استفاده از ژن های اکسیدوردوکتاز افزایش یافته می باشد که fmnh2 مورد نیاز برای فعالیت ژن های گوگردزدایی را در دسترس قرار می دهند. در این مطالعه ژن اکسیدوردوکتاز باکتری رودوکوکوس اریتروپولیس igts8 که به عنوان یک سویه مد...

full text

شناسایی و کلونینگ اپرون سولفورزدایی SOX (dszA, B) در باکتری بومی رودوکوکوس FMF

سابقه و هدف: باکتری بومی رودوکوکوس FMF از میان چندین سویه که از خاک مناطق مختلف ایران جدا شده بود، انتخاب گردید. مطالعات اولیه نشان داد که این باکتری دارای توانایی مصرف دی‌بنزوتیوفن به عنوان منبع گوگرد می‌باشد. از آن‌جا که فعالیت حذف گوگرد طی یک مسیر حفظ شده صورت می‌پذیرد، طرح حاضر با هدف شناسایی، کلونینگ و تعیین توالی نوکلئوتیدی ژن‌های گوگردزدا در این باکتری طراحی و اجرا شد. مواد و روش‌ها: در...

full text

کلونینگ و بیان ژن کد کننده آنزیم لاکاز از باکتری باسیلوس آنتراسیس سویه QZA2

لاکازها به دلیل توانایی اکسیداسیون طیف گسترده‌ای از ترکیبات فنولی کاربردهای بیوتکنولوژیکی گوناگونی دارند. در این مطالعه سویه بومی QZA2 که از خاک‌های ایران جدا شده است مورد استفاده قرار گرفت. این سویه بر اساس توالی SrRNA 16دارای بیش‌ترین شباهت به باکتری باسیلوس آنتراسیس سویه ATCC 14578 بود. ژن کد کننده آنزیم لاکاز از سویه QZA2 به وسیله پرایمرهای کلونینگ تکثیر شد و سپس محصول PCR در ناقل بیانی (pE...

full text

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
کومش

جلد ۶، شماره ۴، صفحات ۳۲۵-۳۳۴

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023